名古屋水族馆是由1992年开业的南馆和2001完成的北馆这两个馆厅组成的。
南馆的主题是“南极之旅”。是从名古屋出发纵惯地球到达南极，在旅途中碰到的各种各样水域其生物生长的自然环境，并把它划分为5类，再现了“日本之海”“深海回廊”“赤道之海”“澳大利亚的水边”“南极之海”。
在这里我们可以参观到各个不同自然生长环境中各种各样的生命。
北馆的主题是“35亿年漫长岁月的历史-重新返回大海的动物们”。在漫长的进化史中，及具有适应在海水中生活特性，又有着和我们人类一样的感知能力的鲸鱼展览上也别出心裁。
在日本最大型主泳池里上演的海豚表演，也是最受观众欢迎的。